저와 비슷한 경우를 겪으시네요. ^^

우선 저희 서버에.. mod_security.c 패치를 하였습니다.
모든 업데이트 상황은 제가 잘알기때문에 최근에 mod_security 를 패치하고 난 후부터 업로드가 안되어..

결국..

.htaccess 를 열어.. 아래 3줄을 추가 해주니 정상적으로 작동을 하고 있네요.^^;;

SecFilterEngine Off
SecFilterScanPOST Off
SecFilterCheckURLEncoding Off

혹시라도 서버에 mod_security.c 가 있는지 확인 해보세요.

뭐.. 이쪽이 아니라면..;; 잘 모르겠네요;;