사용자 계정 디렉토리로 옮기셨다면 /home/userid가 아니라 /home/userid/public_html 아래의 어딘가로 옮기셨다는 얘기인데(일단 글로 봐서는 tc 디렉토리로 옮기신 듯), 그렇다면 텍스트큐브가 영향을 받는 것은 다음과 같습니다.

1. /home/userid/public_html의 .htaccess (다른 프로그램에 의해 설치되었을 수 있음)
2. /home/userid/public_html/tc에 .htaccess 파일이 정상적으로 복사되었는지 여부 (숨김 파일이므로 혹시 빠졌을 수도 있습니다)
3. tc 디렉토리 내부의 퍼미션 문제 (일반적으로 쉘에서 mv 명령 등으로 그대로 옮겼다면 문제가 없어야 하나, ftp 클라이언트 등으로 옮겼다면 제대로 설정되지 않았을 가능성이 있습니다)

위의 사항들을 점검해보시고, 정확히 어떤 디렉토리의 .htaccess 파일을 말씀하시는 건지 알려주시면 좀더 도움이 될 것 같네요. 일단 /var/www 디렉토리를 접근할 권한이 있는 걸 보니 서버를 직접 운영하시는 듯한데... 아파치 설정에도 문제가 없는지(mod_rewrite를 사용하기 위해 허용해주어야 하는 설정 등), 웹서버 에러 로그 파일(보통 500 error가 발생하면 서버 로그에 에러 사유가 기록됩니다) 등을 확인해보시는 게 좋겠습니다.