사이드바의 목적이 그렇게 쓰이게끔 제작된게 스킨이 아니라 공사가 좀 크겠네요.
우선 전체영역의 #containerBox 와 그 안에 #content 와 #sidebar가 좌우로 배열되어 있습니다.
#containerBox에 배경색을 집어넣으면 블로그 전체를 감싸고 있는 영역이기에 모든 영역에 배경색이 들어갑니다.
이에 본문영역인 #content는 물론 상단, 하단 영역 그리고  #sidebar에서 각각의 컨텐츠들(카테고리, 태그, 댓글 배너 등)을 제외하고는 배경색을 흰색 #FFFFFF 로 지정해야 합니다.

요게 번거로운 작업이지만, 기존의 스킨의 html을 코드를 건들이지 않고 css만으로 제어하는 경우이고 skin.html을 건들여 작업하면 별도의 div를 사이드바로 감싸거나 하여 가능할 것도 같습니다 . 아마 이게 약간은 덜 수고적인 작업이지 않나 싶기도 합니다만 어쨌든간에 수정할 부분이 많은건 사실이네요.

코드를 직접 드리고 싶었지만, 아마 이렇게 해도 원하는대로의 맘에드는 결과물은 나오지 않을 듯 싶어 대략 과정이 이렇다는걸 먼저 설명드리고자 적습니다.