20, 41 이 두가지가 의심이 가긴합니다.
플러그인 제작자가 어떤 코드를 작성했는지는 알 수가 없습니다. 백지가 난다면, 잘 못된 코드이거나 최신버전과 호환이 되지 않는다는 것입니다.
하나씩 켜보는게 가장 좋은 방법일 듯 싶습니다.
다른 js 코드를 넣거나 그런게 있다면
특별한 경우를 제외하고는 기존에 쓰던 js 코드는 문제가 없겠지만, 고것도 확인해 보시면 좋을 듯 싶습니다.

정확히 어떤 플러그인이 본문에 관여되는지를 몰라서 활성화된 플러그인 목록을 적어보겠습니다.

1. Blog API
2. FAS: Frypan Antispam Service
3. FootNote
4. Google 맵
5. Graphic Statistics
6. JP Archive to Calendar
7. JP Archive to Selectbox
8. JP Blog Logo Manager
9. JP Flash Counter View
10. JP Flickr와 YouTube 미디어 검색
11. JP Notice for link and commenter
12. JP Thumbnail List/sidebar/Cover view
13. JP 검색어 하이라이트 표시
14. JP 긴 링크 짧게 표시
15. JP 블로그 통계
16. JP 신규 '댓글/방명록/댓글 알리미'
17. JP 엔트리 본문 짧게 줄이기
18. JP 플러그인 설정관리
19. JP 필터 데이터 관리
20. MAV Image HighSlide View
21. Markdown 포매터
22. OpenID
23. RSS News
24. SNS에 글 보내는 단추 달기
25. TAGRELATION (TextCube)
26. TTML 포매터
27. Textile 포매터
28. URL keeper
29. 같은 카테고리의 다른 글 더보기
30. 날짜 언어/형식 변경 플러그인
31. 리퍼러 검색어 통계
32. 리퍼러 기록
33. 리퍼러 로그 정리
34. 모든 블로그이 최근 글 보기
35. 모바일 블로그
36. 방문자 기록
37. 배너출력
38. 블로그 아이콘 표시
39. 블로그 접속방지
40. 빈 줄 표시
41. 새창으로 열기 링크
42. 스킨매니저
43. 커버에 카테고리 글목록 표시
44. 크리에이티브 커먼즈 라이센스
45. 키워드 출력
46. 태그 입력기
47. 텍스트큐브 위지윅 편집기
48. 텍스트큐브 최근 플러그인/스킨
49. 텍스트큐브 팁
50. 팀블로그 설정
51. 포스트 부분 비밀글 만들기
52. 피드 구독통계
53. 후라이팬

그리고 추가로 Sunteq Category New라는 플러그인을 설정하면 페이지를 찾지못 합니다.
이건 왜그런가요?

네 의견 고맙습니다.
정상적인 환경에서는 문제가 발생하지 않네요.
본문에 관여되거나 에디터에 관련된 플러그인을 쓰고 계시진 않으신지요?