네. .htaccess 내용을 추가합니다.
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#<IfModule mod_url.c>
#CheckURL Off
#</IfModule>
#SetEnv PRELOAD_CONFIG 1
RewriteEngine On
RewriteBase /

# 하위폴더 접근문제로 추가한 내용
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -f
RewriteRule ^(.*) $1 [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} /phpMyAdmin|/webhard|/freehard|/webftp|/ssu
RewriteRule ^(.*) - [L]
# 추가내용 종료

RewriteRule ^(thumbnail)/([0-9]+/.+)$ cache/$1/$2 [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -f
RewriteRule ^(cache)+/+(.+[^/])\.(cache|xml|txt|log)$ - [NC,F,L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -d
RewriteRule ^(.+[^/])$ $1/ [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteRule ^(.*)$ rewrite.php [L,QSA]
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추가한 내용이 없어도 똑같이 접속지연이 있습니다.
그리고, 어제오후에 오픈아이디와 관리자계정을 연결시켜 놓고 접속해보니 오픈아이디로는 로그인이 잘 됩니다.

[서버환경 ]
OS : SUlinux 1.5 Server (2.6.9-67.0.20.ELsmp)
MySQL : 4.1.22
PHP : 5.1.6
Apache : 2.0.59
Zend Optimizer : 3.0.1

감사합니다.